La madera transparente se obtiene al modificar las propiedades de la madera común, eliminando químicamente uno de sus componentes, la lignina. Ésta es propia de todos los tejidos leñosos vegetales y tiene como función el mantener unidas las fibras de celulosa, así como funciones esenciales para la fortaleza de los vegetales y el mejoramiento de su sistema de defensa.
La lignina además de proporcionar rigidez al vegetal, le confiere color oscuro y su presencia en la madera bloquea alrededor del 90% de paso de luz, de ahí la relevancia de eliminar esta sustancia, para convertir la madera en un material blanco y transparente.
Uno de los principales retos del proceso de fabricación de madera transparente, es la producción sin debilitar la estructura de la madera, por lo cual actualmente se usan estrategias optimizadas en las que no se elimina la lignina, sino que se modifica mediante un cepillado químico asistido por energía solar, garantizando que el material modificado además de transparente sea resistente a la tracción.

La madera transparente además de ser suave y translúcida, permite un uso versátil en diseño, arquitectura y construcción. La madera es uno de los materiales de construcción más usados mundialmente por su baja densidad, conductividad térmica, durabilidad y accesibilidad, por lo cual la madera transparente es ideal para ser usada como opción barata y renovable, capaz de crear espacios luminosos mediante cristalería, fachadas y un sinnúmero de posibilidades.